蛋白質(zhì)（protein）是有機大分子，是構(gòu)成細胞的基本有機物和生命活動的主要承擔(dān)者。蛋白質(zhì)在催化生命體內(nèi)各種反應(yīng)進行、新陳代謝、抵御外來物質(zhì)入侵及控制遺傳信息等方面都起著重要的作用。蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)是氨基酸序列，通過鑒定氨基酸序列來匹配它的蛋白質(zhì)，這是定性研究，是蛋白質(zhì)組學(xué)的基礎(chǔ)，也是蛋白質(zhì)組學(xué)的重要技術(shù)之一。

質(zhì)譜一般由離子源（Ion source）、質(zhì)量分析器（Mass analyzer）和離子檢測器（Detector）三部分組成。傳統(tǒng)的質(zhì)譜僅用于小分子揮發(fā)物質(zhì)的分析，但隨著新的離子化技術(shù)的出現(xiàn)，如基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF)和電噴霧電離質(zhì)譜(ESI-MS)等，質(zhì)譜技術(shù)的出現(xiàn)為蛋白質(zhì)分析提供了一種新的途徑?，F(xiàn)在蛋白質(zhì)組學(xué)基本研究手段是：以生物質(zhì)譜技術(shù)為核心，對蛋白質(zhì)進行大規(guī)模、高通量分離、鑒定和分析。

蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定的基本原理是用蛋白酶將蛋白質(zhì)消化成肽段混合物，經(jīng)MAILDI或ESI等軟電離手段將其離子化，然后通過質(zhì)量分析器將具有特定質(zhì)核比的肽段離子分離開來。通過實際譜圖和理論上蛋白質(zhì)經(jīng)過蛋白酶消化后產(chǎn)生的一級質(zhì)譜峰圖和二級質(zhì)譜峰圖進行的比對，進行蛋白鑒定。

技術(shù)特點

• 高通量、自動化程度高、分離能力強；

• 通用性強，可分析蛋白質(zhì)條帶、免疫共沉淀洗脫液、組織提取液、全細胞裂解液、亞細胞分離組分等多種形式的樣品。

應(yīng)用領(lǐng)域介紹

• 蛋白質(zhì)膠點鑒定

• 蛋白質(zhì)膠條鑒定

• 蛋白翻譯后修飾位點鑒定

• 蛋白N端、C端測序