iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技術(shù)是分別由美國AB Sciex公司和Thermo Fisher公司研發(fā)的多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)。這兩種技術(shù)采用多個(2-10)穩(wěn)定同位素標(biāo)簽,特異性標(biāo)記多肽的氨基基團(tuán)進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析,能夠同時比較多達(dá)10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對含量,可用于研究不同病理?xiàng)l件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達(dá)水平的差異。
對于可以傳代的細(xì)胞樣品來說,我們可以采取SILAC的方法完成對于細(xì)胞蛋白質(zhì)組的標(biāo)記過程,但是許多其他研究體系,比如組織樣品以及不能進(jìn)行傳代培養(yǎng)的細(xì)胞來說,需要其他的標(biāo)記方法來完成定量蛋白組學(xué)分析。TMT, iTRAQ等基于體外(in vitro)標(biāo)記的定量方法應(yīng)運(yùn)而生。
iTRAQ標(biāo)簽包括三部分,如下圖:
1. 報告基團(tuán)(reporter group):指示蛋白樣品豐度水平。
2. 平衡基團(tuán)(balance group):平衡報告基團(tuán)的質(zhì)量差,使等重標(biāo)簽重量一致,保證標(biāo)記的同一肽段m/z相同。
3. 肽反應(yīng)基團(tuán)(amine-specific reactive group):能與肽段N端及賴氨酸側(cè)鏈氨基發(fā)生共價連接,從而標(biāo)記上肽段。
iTRAQ和TMT標(biāo)簽結(jié)構(gòu)圖
來自不同樣品的同一肽段經(jīng)TMT/iTRAQ試劑標(biāo)記后具有相同的質(zhì)量數(shù),并在一級質(zhì)譜檢測(MS1)中表現(xiàn)為同一個質(zhì)譜峰。當(dāng)此質(zhì)譜峰被選定進(jìn)行碎裂后,在二級質(zhì)譜檢測(MS2)中,不同的報告基團(tuán)被釋放,它們各自的質(zhì)譜峰的信號強(qiáng)弱,代表著來源于不同樣品的該肽段及其所對應(yīng)的蛋白的表達(dá)量的高低。TMT/iTRAQ定量蛋白組學(xué)研究因其測定精準(zhǔn)度高適應(yīng)樣品種類多,目前已有很廣泛的應(yīng)用。百泰派克在傳統(tǒng)的TMT/iTRAQ分析技術(shù)的基礎(chǔ)上,提供TMT/iTRAQ/MultiNotch MS分析技術(shù),使用三級碎片報告離子進(jìn)行定量,可進(jìn)一步提高TMT/iTRAQ定量蛋白組學(xué)分析的精度,進(jìn)一步提高定量準(zhǔn)確性。
百泰派克公司采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF質(zhì)譜平臺,Orbitrap Fusio Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,推出基于TMT/iTRAQ/MultiNotch MS的定量蛋白組分析服務(wù)技術(shù)包裹,您只需要將您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康母嬖V我們并將您的蛋白寄給我們,我們會負(fù)責(zé)項(xiàng)目后續(xù)所有事宜,包括蛋白酶切、肽段標(biāo)價、肽段分離、質(zhì)譜分析、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)分析、生物信息學(xué)分析。
iTRAQ/TMT定量蛋白組學(xué)分析實(shí)驗(yàn)流程

iTRAQ/TMT定量蛋白組學(xué)分析技術(shù)特點(diǎn)
? 高通量定量蛋白分析:可以同時分析10個樣品;適合大量臨床樣本,多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物
? 體外標(biāo)記,適用于分析組織,細(xì)胞,血液等多種樣品
? 質(zhì)譜分析靈敏度高,可檢測較低豐度蛋白,大范圍比較蛋白相對豐度
? 可與富集磷酸化等修飾肽段的方法聯(lián)用,更準(zhǔn)確研究翻譯后修飾變化
iTRAQ/TMT定量蛋白組學(xué)分析樣品要求

注意:樣品運(yùn)輸請使用足量的干冰運(yùn)輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運(yùn)輸過程中樣品降解的可能性。
中/英文項(xiàng)目報告
在技術(shù)報告中,百泰會為您提供詳細(xì)的中英文雙語版技術(shù)報告,報告包括:
1, 實(shí)驗(yàn)步驟(中英文); 2, 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)(中英文); 3, 鑒定的氨基酸的詳細(xì)信息; 4, 質(zhì)譜圖片; 5, 原始數(shù)據(jù)
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